مقاومت ضد میکروبی (AMR یا AR) زمانی اتفاق می افتد که میکروب ها مکانیسم هایی را در خودشان به وجود می آورند که از آن ها در برابر اثرات داروهای ضدمیکروبی محافظت می کند. مقاومت آنتی بیوتیکی (AR یا ABR) نیز زیرمجموعه AMR است و به باکتری هایی اطلاق می شود که به آنتی بیوتیک ها مقاوم شده اند. درمان میکروب هایی که مقاومت گرفته اند، دشوارتر است و به دوزهای بالاتر یا داروهای جایگزین احتیاج دارند که ممکن است سمی تر نیز باشند. این درمان ها ممکن است گران تر باشند. برخی میکروب ها در برابر چند داروی ضد میکروبی مقاومت دارند که به این حالت (MDR) گفته می شود.